伊斯蘭教自產生起，教派與教派鬥爭便始終貫穿於其歷史發展的整個進程。其中有政治派別、法學派別和神學派別之爭，各有其產生的社會背景和思想淵源，代表了伊斯蘭教及其思想發展的主流。不同的派別有不同的教義，但它們都是伊斯蘭教文化不可或缺的組成部分。
一、遜尼派
遜尼派是伊斯蘭教的主要政治宗教派別之一。全稱為“遜奈和大眾派”，自稱正統派。它是伊斯蘭教中人數最多、分佈最廣的主流派，世界穆斯林大多屬遜尼派，佔全世界穆斯林總數的80％以上。
1.形成及發展
656年第三任哈里發奧斯曼被刺後，敍利亞總督穆阿維葉對阿里繼任哈里發表示不滿。雙方為爭奪哈里發的職位爆發了隋芬之戰。阿里在獲勝情況下，接受對方提出以《古蘭經》裁判的和談建議，從而出現了既反對穆阿維葉又反對阿里的哈瓦利吉派。661年初，阿里被哈瓦利吉派刺殺後，穆阿維葉取得了哈里發職位。因此，圍繞着哈里發問題的激烈爭論，又形成了什葉派和穆爾吉埃派。什葉派不承認前三位哈里發和穆阿維葉作為哈里發的合法性。穆爾吉埃派對此則持温和態度，主張哈里發問題應“推延”到後世由安拉裁決。而多數人則承認四位哈里發的合法地位，但對穆阿維葉擔任哈里發職位一事，既不表示反對，也不表示承認。他們除尊崇《古蘭經》外，還特別強調以聖訓為立法、立論的依據，故被稱為遵守“遜奈”（聖訓）的人們，即遜尼派。嗣後，該派在同哈瓦利吉派和什葉派的鬥爭過程中，建立了自己的政治思想體系，以後又在同穆爾太齊賴派的長期論爭中，逐步建立了自己的教義、哲學思想和教法學體系，從而使初期的政治派別轉而成為宗教派別。
2.基本教義
在教義學上，該派在反對穆爾太齊賴派和什葉派的鬥爭中，於11世紀正式接受艾什爾裏派的教義學為本派的正統教義，後伊斯蘭教權威學者安薩里將蘇菲派神祕主義引入正統思想，最終完成了遜尼派完整的教義體系，它為世界大多數穆斯林所奉行。
該派信仰神學理論主要有以下幾個方面：
（1）安拉的本體與德性。認為安拉是宇宙間唯一的主宰，安拉的本體是第一性的，其德性是第二性的。
（2）《古蘭經》的性質。認為《古蘭經》是最高、最神聖的天經，是安拉的言語，是天使按原型口授給穆罕默德的。內在的啟示並不寓於穆斯林的書、心、口、耳之中。
（3）前定與意志自由。既承認安拉的前定，又承認個人有意志自由。認為安拉周知萬物，過去和未來的事件完全在安拉的洞察之中。任何人和物都是安拉所創造的，因而人類的意志自由是在萬能的安拉的意志下選擇的，人能夠掌握自己的行為，只是因為有辨別是非的能力。
二、什葉派
什葉派是與遜尼派、哈瓦利吉派、穆爾吉埃派並稱為早期伊斯蘭教的四大政治派別，是伊斯蘭教中僅次於“遜尼派”的第二大教派。“什葉”的阿拉伯語意為“黨人”、“派別”。該派以擁護穆罕默德的堂弟、女婿阿里及其後裔擔任穆斯林領袖伊瑪目為其主要特徵。後因內部主張分歧，又相繼分化出凱薩尼派、宰德派、伊斯瑪儀派（七伊瑪目派）、十二伊瑪目派等派別和許多支系。目前，全世界什葉派穆斯林約有8000多萬人。主要分佈在伊朗、伊拉克、巴基斯坦、印度、土耳其、阿富汗、黎巴嫩、沙特阿拉伯、也門、巴林等地區。
1.形成及發展
穆罕默德逝世後，穆斯林內部曾在由誰擔任哈里發（繼任人）的問題上發生分歧。後經協商，先後推選艾卜？伯克爾、歐麥爾和奧斯曼為第一、二、三任哈里發。但在此期間，仍有人主張穆罕默德的權力應由其親屬中信教最早、追隨穆罕默德傳教有功的阿里來繼承。據什葉派的傳述，當時穆罕默德的門弟子賽爾曼。法裏西、艾卜？達爾等人宣稱穆罕默德生前曾有遺囑指定阿里為繼承人，從而逐漸形成一個擁護阿里為哈里發的派別勢力，被稱作阿里黨人。656年，奧斯曼被刺後，阿里當選為第四任哈里發。由於部分聖門弟子不承認阿里的哈里發地位，因之先後爆發了駱駝之戰、隋芬之戰和拿赫魯宛之戰。661年阿里遇刺身亡，穆阿維葉取得哈里發地位，建立了伍麥耶王朝，阿里黨人就在反對伍麥耶王朝的鬥爭中逐漸形成和發展成為什葉派。
2.信仰與教義
（1）伊瑪目教義：阿里是穆罕默德的合法繼承人，是第一位伊瑪目，其後只有阿里和法蒂瑪的後裔才是合法的伊瑪目。伊瑪目由安拉任命，誰也無權選舉。伊瑪目具有超凡的神性和“不謬性”。伊瑪目是人與安拉之間的“中保”。只有伊瑪目有權解釋《古蘭經》。
（2）馬赫迪教義：隱遁的伊瑪目將在世界末日前再臨人世，成為伊斯蘭教的馬赫迪（救世主），為世人伸張正義，恢復真正的伊斯蘭教。
（3）塔基亞教義：信徒在有危險的時候允許隱諱自己的宗教信仰，但這只是表面上否認之，內心還必須堅持信仰。
（4）此外，什葉派教義還承認臨時婚姻制度“穆塔爾”。
除了遜尼和什葉這兩大派系，還有其他一些小派系，如哈瓦里吉派、伊斯瑪儀派。
